Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms