Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC7

Smagp, Small cell adhesion glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmagpQ99KC7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SmagpQ99KC7 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms