Protein–RNA interactions for Protein: Q99J38

Ttc30a1, Tetratricopeptide repeat protein 30A1, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc30a1Q99J38 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc30a1Q99J38 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc30a1Q99J38 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc30a1Q99J38 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc30a1Q99J38 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc30a1Q99J38 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc30a1Q99J38 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc30a1Q99J38 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc30a1Q99J38 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc30a1Q99J38 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc30a1Q99J38 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc30a1Q99J38 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc30a1Q99J38 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc30a1Q99J38 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc30a1Q99J38 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc30a1Q99J38 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc30a1Q99J38 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc30a1Q99J38 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc30a1Q99J38 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc30a1Q99J38 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc30a1Q99J38 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc30a1Q99J38 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc30a1Q99J38 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc30a1Q99J38 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc30a1Q99J38 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc30a1Q99J38 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc30a1Q99J38 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc30a1Q99J38 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc30a1Q99J38 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc30a1Q99J38 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc30a1Q99J38 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc30a1Q99J38 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc30a1Q99J38 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc30a1Q99J38 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc30a1Q99J38 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc30a1Q99J38 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc30a1Q99J38 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms