Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Smim11aQ99J19 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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Smim11aQ99J19 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Smim11aQ99J19 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Smim11aQ99J19 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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