Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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Ctu1Q99J10 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Ctu1Q99J10 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Ctu1Q99J10 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Ctu1Q99J10 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Ctu1Q99J10 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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Ctu1Q99J10 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Ctu1Q99J10 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Ctu1Q99J10 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Ctu1Q99J10 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Ctu1Q99J10 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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