Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usb1Q91W78 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usb1Q91W78 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usb1Q91W78 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usb1Q91W78 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usb1Q91W78 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usb1Q91W78 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Usb1Q91W78 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usb1Q91W78 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usb1Q91W78 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usb1Q91W78 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usb1Q91W78 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usb1Q91W78 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usb1Q91W78 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usb1Q91W78 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usb1Q91W78 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usb1Q91W78 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usb1Q91W78 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Usb1Q91W78 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usb1Q91W78 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usb1Q91W78 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usb1Q91W78 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usb1Q91W78 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usb1Q91W78 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usb1Q91W78 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usb1Q91W78 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usb1Q91W78 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Usb1Q91W78 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Usb1Q91W78 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Usb1Q91W78 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usb1Q91W78 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usb1Q91W78 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Usb1Q91W78 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Usb1Q91W78 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Usb1Q91W78 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Usb1Q91W78 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Usb1Q91W78 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Usb1Q91W78 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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