Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc71Q8VEG0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc71Q8VEG0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc71Q8VEG0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc71Q8VEG0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc71Q8VEG0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc71Q8VEG0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc71Q8VEG0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc71Q8VEG0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc71Q8VEG0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc71Q8VEG0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc71Q8VEG0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc71Q8VEG0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc71Q8VEG0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc71Q8VEG0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc71Q8VEG0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc71Q8VEG0 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc71Q8VEG0 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc71Q8VEG0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc71Q8VEG0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc71Q8VEG0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc71Q8VEG0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc71Q8VEG0 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc71Q8VEG0 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc71Q8VEG0 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc71Q8VEG0 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc71Q8VEG0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc71Q8VEG0 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc71Q8VEG0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc71Q8VEG0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc71Q8VEG0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc71Q8VEG0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc71Q8VEG0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc71Q8VEG0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc71Q8VEG0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc71Q8VEG0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc71Q8VEG0 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc71Q8VEG0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc71Q8VEG0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc71Q8VEG0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc71Q8VEG0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc71Q8VEG0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc71Q8VEG0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc71Q8VEG0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc71Q8VEG0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc71Q8VEG0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc71Q8VEG0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc71Q8VEG0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc71Q8VEG0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc71Q8VEG0 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc71Q8VEG0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms