Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms