Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim29Q8R2Q0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms