Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms