Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms