Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc12Q8K2L8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc12Q8K2L8 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc12Q8K2L8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc12Q8K2L8 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc12Q8K2L8 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc12Q8K2L8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc12Q8K2L8 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc12Q8K2L8 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc12Q8K2L8 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc12Q8K2L8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc12Q8K2L8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc12Q8K2L8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc12Q8K2L8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc12Q8K2L8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc12Q8K2L8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc12Q8K2L8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trappc12Q8K2L8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trappc12Q8K2L8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Trappc12Q8K2L8 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
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Trappc12Q8K2L8 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Trappc12Q8K2L8 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms