Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FgbQ8K0E8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FgbQ8K0E8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FgbQ8K0E8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FgbQ8K0E8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FgbQ8K0E8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FgbQ8K0E8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FgbQ8K0E8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FgbQ8K0E8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FgbQ8K0E8 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FgbQ8K0E8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FgbQ8K0E8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FgbQ8K0E8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FgbQ8K0E8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FgbQ8K0E8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FgbQ8K0E8 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FgbQ8K0E8 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FgbQ8K0E8 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FgbQ8K0E8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FgbQ8K0E8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FgbQ8K0E8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FgbQ8K0E8 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FgbQ8K0E8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FgbQ8K0E8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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