Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms