Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms