Protein–RNA interactions for Protein: Q8CF25

UPF0575 protein C19orf67 homolog, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CF25 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8CF25 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8CF25 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8CF25 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8CF25 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8CF25 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q8CF25 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q8CF25 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q8CF25 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q8CF25 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Q8CF25 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q8CF25 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CF25 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CF25 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CF25 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CF25 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CF25 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CF25 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CF25 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CF25 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CF25 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CF25 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CF25 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CF25 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CF25 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CF25 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CF25 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CF25 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CF25 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CF25 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CF25 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CF25 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CF25 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CF25 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CF25 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CF25 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CF25 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CF25 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CF25 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CF25 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8CF25 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8CF25 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8CF25 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8CF25 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8CF25 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8CF25 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8CF25 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8CF25 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8CF25 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8CF25 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8CF25 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8CF25 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8CF25 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8CF25 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8CF25 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8CF25 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8CF25 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8CF25 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8CF25 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8CF25 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8CF25 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8CF25 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8CF25 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8CF25 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8CF25 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8CF25 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8CF25 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8CF25 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8CF25 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8CF25 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8CF25 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8CF25 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8CF25 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8CF25 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8CF25 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8CF25 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8CF25 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8CF25 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8CF25 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8CF25 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8CF25 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q8CF25 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q8CF25 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q8CF25 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Q8CF25 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q8CF25 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q8CF25 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q8CF25 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q8CF25 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q8CF25 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q8CF25 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q8CF25 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q8CF25 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q8CF25 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q8CF25 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q8CF25 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q8CF25 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Q8CF25 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q8CF25 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q8CF25 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms