Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms