Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms