Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDW1

Fam228a, Protein FAM228A, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228aQ8CDW1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam228aQ8CDW1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam228aQ8CDW1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam228aQ8CDW1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam228aQ8CDW1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam228aQ8CDW1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam228aQ8CDW1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam228aQ8CDW1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam228aQ8CDW1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam228aQ8CDW1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam228aQ8CDW1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam228aQ8CDW1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam228aQ8CDW1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam228aQ8CDW1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam228aQ8CDW1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam228aQ8CDW1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam228aQ8CDW1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam228aQ8CDW1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam228aQ8CDW1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam228aQ8CDW1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam228aQ8CDW1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam228aQ8CDW1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam228aQ8CDW1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam228aQ8CDW1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam228aQ8CDW1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam228aQ8CDW1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam228aQ8CDW1 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam228aQ8CDW1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam228aQ8CDW1 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam228aQ8CDW1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms