Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAS9

Parp9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp9Q8CAS9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms