Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms