Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ctdsp2Q8BX07 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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Ctdsp2Q8BX07 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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Ctdsp2Q8BX07 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ctdsp2Q8BX07 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ctdsp2Q8BX07 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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