Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 183.1 ms