Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR65

Suds3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suds3Q8BR65 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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