Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms