Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms