Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BGC1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BGC1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BGC1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BGC1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BGC1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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