Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Liat1Q810M6 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Liat1Q810M6 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Liat1Q810M6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Liat1Q810M6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Liat1Q810M6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Liat1Q810M6 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Liat1Q810M6 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Liat1Q810M6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Liat1Q810M6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Liat1Q810M6 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Liat1Q810M6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Liat1Q810M6 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Liat1Q810M6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Liat1Q810M6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Liat1Q810M6 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Liat1Q810M6 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Liat1Q810M6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Liat1Q810M6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Liat1Q810M6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Liat1Q810M6 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Liat1Q810M6 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Liat1Q810M6 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Liat1Q810M6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Liat1Q810M6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Liat1Q810M6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Liat1Q810M6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Liat1Q810M6 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Liat1Q810M6 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Liat1Q810M6 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Liat1Q810M6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Liat1Q810M6 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Liat1Q810M6 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Liat1Q810M6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Liat1Q810M6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Liat1Q810M6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Liat1Q810M6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Liat1Q810M6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Liat1Q810M6 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Liat1Q810M6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Liat1Q810M6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Liat1Q810M6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Liat1Q810M6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Liat1Q810M6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Liat1Q810M6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Liat1Q810M6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Liat1Q810M6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Liat1Q810M6 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Liat1Q810M6 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Liat1Q810M6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Liat1Q810M6 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Liat1Q810M6 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Liat1Q810M6 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Liat1Q810M6 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Liat1Q810M6 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Liat1Q810M6 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Liat1Q810M6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Liat1Q810M6 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Liat1Q810M6 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Liat1Q810M6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Liat1Q810M6 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Liat1Q810M6 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Liat1Q810M6 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Liat1Q810M6 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Liat1Q810M6 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Liat1Q810M6 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Liat1Q810M6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Liat1Q810M6 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Liat1Q810M6 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Liat1Q810M6 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Liat1Q810M6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Liat1Q810M6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Liat1Q810M6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Liat1Q810M6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Liat1Q810M6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Liat1Q810M6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Liat1Q810M6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Liat1Q810M6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Liat1Q810M6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Liat1Q810M6 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Liat1Q810M6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Liat1Q810M6 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Liat1Q810M6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Liat1Q810M6 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Liat1Q810M6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Liat1Q810M6 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Liat1Q810M6 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Liat1Q810M6 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Liat1Q810M6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Liat1Q810M6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Liat1Q810M6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Liat1Q810M6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Liat1Q810M6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Liat1Q810M6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Liat1Q810M6 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Liat1Q810M6 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Liat1Q810M6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Liat1Q810M6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Liat1Q810M6 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Liat1Q810M6 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms