Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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