Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NischQ80TM9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
NischQ80TM9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
NischQ80TM9 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
NischQ80TM9 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NischQ80TM9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NischQ80TM9 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
NischQ80TM9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NischQ80TM9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NischQ80TM9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NischQ80TM9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NischQ80TM9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NischQ80TM9 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NischQ80TM9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NischQ80TM9 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NischQ80TM9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NischQ80TM9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NischQ80TM9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NischQ80TM9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NischQ80TM9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NischQ80TM9 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NischQ80TM9 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
NischQ80TM9 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NischQ80TM9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NischQ80TM9 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NischQ80TM9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NischQ80TM9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NischQ80TM9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms