Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms