Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sbno2Q7TNB8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sbno2Q7TNB8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sbno2Q7TNB8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sbno2Q7TNB8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms