Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms