Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ncapd3Q6ZQK0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms