Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms