Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp34Q6ZQ93 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp34Q6ZQ93 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp34Q6ZQ93 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp34Q6ZQ93 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp34Q6ZQ93 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp34Q6ZQ93 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp34Q6ZQ93 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp34Q6ZQ93 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp34Q6ZQ93 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp34Q6ZQ93 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp34Q6ZQ93 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp34Q6ZQ93 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp34Q6ZQ93 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp34Q6ZQ93 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp34Q6ZQ93 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp34Q6ZQ93 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp34Q6ZQ93 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp34Q6ZQ93 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp34Q6ZQ93 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms