Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms