Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sarm1Q6PDS3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms