Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gapvd1Q6PAR5 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gapvd1Q6PAR5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms