Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smchd1Q6P5D8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms