Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms