Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrimpolQ6P1E7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PrimpolQ6P1E7 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PrimpolQ6P1E7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PrimpolQ6P1E7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PrimpolQ6P1E7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PrimpolQ6P1E7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PrimpolQ6P1E7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrimpolQ6P1E7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrimpolQ6P1E7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrimpolQ6P1E7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrimpolQ6P1E7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrimpolQ6P1E7 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrimpolQ6P1E7 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrimpolQ6P1E7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PrimpolQ6P1E7 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrimpolQ6P1E7 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrimpolQ6P1E7 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrimpolQ6P1E7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrimpolQ6P1E7 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrimpolQ6P1E7 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrimpolQ6P1E7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrimpolQ6P1E7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrimpolQ6P1E7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrimpolQ6P1E7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrimpolQ6P1E7 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PrimpolQ6P1E7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrimpolQ6P1E7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrimpolQ6P1E7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrimpolQ6P1E7 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrimpolQ6P1E7 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PrimpolQ6P1E7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PrimpolQ6P1E7 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PrimpolQ6P1E7 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms