Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms