Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms