Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SphkapQ6NSW3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SphkapQ6NSW3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SphkapQ6NSW3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SphkapQ6NSW3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SphkapQ6NSW3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SphkapQ6NSW3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SphkapQ6NSW3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SphkapQ6NSW3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SphkapQ6NSW3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SphkapQ6NSW3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SphkapQ6NSW3 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SphkapQ6NSW3 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SphkapQ6NSW3 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SphkapQ6NSW3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SphkapQ6NSW3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SphkapQ6NSW3 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SphkapQ6NSW3 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SphkapQ6NSW3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SphkapQ6NSW3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SphkapQ6NSW3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SphkapQ6NSW3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SphkapQ6NSW3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SphkapQ6NSW3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SphkapQ6NSW3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SphkapQ6NSW3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SphkapQ6NSW3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SphkapQ6NSW3 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms