Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms