Protein–RNA interactions for Protein: Q6A065

Cep170, Centrosomal protein of 170 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170Q6A065 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cep170Q6A065 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms