Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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