Protein–RNA interactions for Protein: Q64124

Scx, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScxQ64124 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScxQ64124 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScxQ64124 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScxQ64124 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScxQ64124 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScxQ64124 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScxQ64124 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScxQ64124 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScxQ64124 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms