Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf260Q62513 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms